NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘 ...

SDR-seq技术的出现，为我们提供了一个前所未有的新“罗盘”。它不仅能将我们精确地导航到那片森林，还能让我们直接走进每一户人家，亲眼看到他们的炉灶 (基因型) 和锅里煮着的食物 (基因表达)。 SUM-seq作为一项创新的单细胞多组学分析技术，以其前所未有的 ...

本文推荐研究人员开发的pyALRA工具，该Python实现解决了单细胞RNA测序(scRNA-seq)中技术性零值("dropout")的插补问题。通过采用自适应阈值低秩逼近(ALRA)算法，研究证明pyALRA在保持生物学零值的同时，显著提升了计算效率和内存使用率，为Python生态的单细胞分析提供了 ...

循环游离 RNA（cfRNA）是一类存在于血液中的短片段 RNA，被认为来自机体细胞凋亡、组织更新或外泌体释放。然而，cfRNA 易被 RNA 酶降解、含量低、片段短，长期以来它并不被视为液体活检的理想材料。 2025 年 7 月 8 日，芝加哥大学何川教授团队、香港科技大学张 ...

本研究针对传统RNA测序(RNA-seq)流程繁琐、成本高昂的问题，开发了TIRE-seq（Turbocapture Integrated RNA Expression Sequencing）技术。该技术通过将mRNA纯化直接整合到文库制备中，省去单独RNA提取步骤，显著提升测序效率和数据质量。研究团队在人类T细胞激活、树突状细胞 ...

基因组DNA是生命的蓝图，对基因组DNA实现任意尺度的精准操作代表对生命蓝图进行修改绘制的底层能力，是基因工程技术发展的核心。以CRISPR基因编辑技术为代表的技术进步实现了基因组单碱基和短序列尺度的精准编辑，基本解决了基因组精准编辑的挑战。

之前整理的一篇大综述 — Nature重磅综述 |关于RNA-seq，你想知道的都在这收到了热烈反响，阅读人数过万。 行文很长，最后精炼下来的文字近三万，适合深度阅读思考。 上次发出时，有读者留言说部分专业名词不理解。为了方便理解和对综述有个概览，特整理了 ...

人类基因组是由约30亿个字符组成的遗传“密码本”，决定细胞和个体发育的命运。该“密码本”中80%的字符能够转录成为“暗物质”核糖核酸（RNA）。这些“暗物质”RNA大多数都是不具有帽子结构的RNA（noncapped RNA，napRNA），且普遍作为非编码RNA（ncRNA）在基因 ...

RNA测序（RNA-seq）在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。RNA-seq帮助大家对RNA生物学的理解会越来越全面：从转录本在何时何地转录到RNA折叠以及分子互作发挥功能等。 1.RNA-seq相关名词详细介绍了RNA seq的专业词 ...

肿瘤微环境（TME）调节着肿瘤的生存、维持、生长和免疫监测，在疾病进展和治疗反应中起着重要作用，如局部耐药、免疫逃逸和癌症转移等。阐明不同细胞群中TME细胞的组成及其功能有助于探索更有效的肿瘤治疗方法。 批量RNA测序（bulk RNA-seq）可以在给定时间 ...